More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5932 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5932  succinoglycan biosynthesis protein  100 
 
 		 319 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4950  glycosyl transferase family protein  67.71 
 
 		 319 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198501  normal  0.142154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2495  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0115  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 339 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.31 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  43 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.33 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.33 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.21 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  41.12 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  35.9 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  35.38 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.67 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  41.58 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.29 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  38.83 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.29 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.61 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.65 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  36.21 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.16 
 
 		 1168 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  35.11 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  34.17 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  38.61 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 1035 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.38 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.84 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  37.25 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  39.39 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.61 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  39.39 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  36.84 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  39.39 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  37.19 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.03 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  31.48 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  33.98 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>