250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2495 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2495  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 345 aa  712    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5932  succinoglycan biosynthesis protein  29.89 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4950  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198501  normal  0.142154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0115  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.54 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.54 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1691  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.7 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  35.92 
 
 		 102 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  32.74 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.57 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.31 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  28.49 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  36.04 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.03 
 
 		 1157 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 573 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 573 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.78 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35.64 
 
 		 1168 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.35 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  29.71 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  32.11 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 250 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  34.95 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  31.96 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2173  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 		 662 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.43 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 553 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 		 155 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  34.48 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 		 1015 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8503  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396799  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 289 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  29.2 
 
 		 292 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.45 
 
 		 403 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  32.99 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  36.63 
 
 		 1148 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  27.23 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  31.36 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 272 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.17 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0638  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 260 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1414  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 269 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  36.36 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>