100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1538 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  100 
 
 		 251 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  85.35 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  74.71 
 
 		 197 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  71.04 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  64.54 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  76.32 
 
 		 196 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  84.73 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  42.2 
 
 		 155 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  42.2 
 
 		 155 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  36.72 
 
 		 155 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  35.94 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  35.54 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  33.8 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  34.78 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  35.96 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  36.84 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  34.09 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  31.54 
 
 		 503 aa  75.9  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  34.15 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  31.54 
 
 		 503 aa  75.9  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  35.96 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  35.96 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  35.96 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  33.33 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  36.84 
 
 		 177 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  34.62 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  32.46 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  26.85 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  38.46 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  29.86 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  34.15 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  38.46 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  35.09 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  33.33 
 
 		 149 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  35.65 
 
 		 160 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  33.65 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  33.83 
 
 		 1220 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  34.21 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  41 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  34.15 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  34.21 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  34.62 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  34.62 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  36.19 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  34.62 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  31.85 
 
 		 1055 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  34.62 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  34.62 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  34.62 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  34.62 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  34.65 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  35.24 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  33.08 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  33.86 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  32.03 
 
 		 154 aa  62  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  29.63 
 
 		 980 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  31.25 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  31.67 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  31.21 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  37.07 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  33.33 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  32.2 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  28.57 
 
 		 980 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  32.73 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  34.07 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  28.97 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  31.11 
 
 		 1469 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  28.32 
 
 		 834 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  26.37 
 
 		 812 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  32.38 
 
 		 106 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  30.08 
 
 		 161 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  27.83 
 
 		 551 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  29.75 
 
 		 159 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  25.81 
 
 		 454 aa  49.3  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  28.97 
 
 		 1782 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  29.63 
 
 		 164 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04270  hypothetical protein  28.83 
 
 		 647 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0242249  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01150  polycomb protein e(z), putative  27.87 
 
 		 717 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  27.72 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00219  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09180)  35.29 
 
 		 598 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  30.3 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  27.78 
 
 		 1361 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  31.25 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  31.25 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  31.25 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  31.25 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  31.25 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44204  predicted protein  29.31 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  31.25 
 
 		 131 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1535  hypothetical protein  31.73 
 
 		 194 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00720131  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  43.48 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  27.2 
 
 		 156 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15174  predicted protein  33.33 
 
 		 253 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000235527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>