48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1635 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  100 
 
 
155 aa  320  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  69.01 
 
 
150 aa  205  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  60.39 
 
 
162 aa  191  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  66.42 
 
 
151 aa  189  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  56.34 
 
 
156 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  54.73 
 
 
156 aa  176  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  63.72 
 
 
154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  29.2 
 
 
178 aa  57.4  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2004  nuclear protein SET  32.43 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216371  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1319  nuclear protein SET  34.65 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  35 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0784  nuclear protein SET  31.78 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.348835  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0660  nuclear protein SET  33.94 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.388607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  35 
 
 
213 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  31.67 
 
 
230 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0031  SET domain protein  35.19 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  35.71 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  36.27 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  31.36 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  35.29 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  35.29 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  35.29 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  35.29 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  35.29 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  35.29 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  35.29 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  35.29 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  30.95 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  32 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  32 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  31.82 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  29.91 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  31.62 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  30.51 
 
 
252 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  30.83 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  30.77 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  31.19 
 
 
245 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  28.68 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  29.46 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  26.23 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  26.23 
 
 
174 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  26.85 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  29.91 
 
 
172 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  30.77 
 
 
1987 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  43.48 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  26.23 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45293  predicted protein  27.56 
 
 
533 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_7553  predicted protein  25.96 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>