28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2004 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2004  nuclear protein SET  100 
 
 		 129 aa  267  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216371  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1319  nuclear protein SET  42.61 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0031  SET domain protein  40.35 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  39.47 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  39.47 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  39.47 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  39.47 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  39.47 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  39.47 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  39.47 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  39.47 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  39.47 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  39.47 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  41.67 
 
 		 178 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0660  nuclear protein SET  40.98 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.388607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0784  nuclear protein SET  37.07 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.348835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04270  hypothetical protein  38.02 
 
 		 647 aa  77  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0242249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  35.9 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  38.18 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  35.4 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  32.43 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  30.77 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_7553  predicted protein  32.46 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  31.73 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  32.69 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00720  histone-lysine n-methyltransferase, h3 lysine-9 specific, putative  50 
 
 		 1691 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  31.86 
 
 		 860 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45088  predicted protein  25 
 
 		 491 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>