53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04270 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC04270  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1331    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0242249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2004  nuclear protein SET  38.02 
 
 		 129 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216371  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_7553  predicted protein  37.82 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1319  nuclear protein SET  31.93 
 
 		 122 aa  68.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  33.62 
 
 		 131 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  33.62 
 
 		 131 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0031  SET domain protein  32.76 
 
 		 131 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  33.62 
 
 		 131 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  33.62 
 
 		 131 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  32.76 
 
 		 131 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  33.62 
 
 		 131 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  33.62 
 
 		 134 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  33.62 
 
 		 134 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  33.62 
 
 		 134 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  30.7 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30000  tRNA-specific adenosine-34 deaminase subunit  23.75 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.903908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  31.75 
 
 		 129 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0784  nuclear protein SET  31.03 
 
 		 132 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.348835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0660  nuclear protein SET  34.58 
 
 		 138 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.388607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  30.28 
 
 		 230 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30712  predicted protein  27.55 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.516627 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  31.87 
 
 		 177 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.87 
 
 		 177 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  35.29 
 
 		 149 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  33.93 
 
 		 151 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  48.84 
 
 		 164 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  28.83 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 193 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.59 
 
 		 189 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  30.23 
 
 		 222 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.59 
 
 		 252 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.52 
 
 		 231 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0843  nuclear protein SET  31.25 
 
 		 135 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.538109  normal  0.284087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.23 
 
 		 164 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  47.62 
 
 		 182 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  41.3 
 
 		 152 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  36.99 
 
 		 146 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.3 
 
 		 147 aa  44.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  30.23 
 
 		 222 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  26.61 
 
 		 245 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1683  hypothetical protein  26.52 
 
 		 561 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  40.82 
 
 		 151 aa  44.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.22 
 
 		 147 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.65 
 
 		 157 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.22 
 
 		 147 aa  44.3  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 		 148 aa  44.3  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  46.51 
 
 		 183 aa  44.3  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.51 
 
 		 182 aa  44.3  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.51 
 
 		 182 aa  44.3  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  41.86 
 
 		 205 aa  43.9  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.48 
 
 		 170 aa  43.9  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  27.27 
 
 		 150 aa  43.9  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 		 147 aa  43.9  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>