133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30000 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30000  tRNA-specific adenosine-34 deaminase subunit  100 
 
 		 325 aa  675    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.903908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04270  hypothetical protein  23.75 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0242249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.62 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.83 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.53 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  32.53 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.05 
 
 		 142 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  32.39 
 
 		 152 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  25 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  23.85 
 
 		 170 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  25 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  30.56 
 
 		 151 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  29.7 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  24.34 
 
 		 172 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  24.34 
 
 		 172 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  24.34 
 
 		 172 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  25.69 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  29.7 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  25.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  36.36 
 
 		 156 aa  53.1  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  25.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  25.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  25.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  25.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 137 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30712  predicted protein  22.01 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.516627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  29.29 
 
 		 200 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.29 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  20.67 
 
 		 152 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.92 
 
 		 170 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  29.29 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  29.29 
 
 		 187 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  24.79 
 
 		 165 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  27.21 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 174 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.48 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43326  predicted protein  21.04 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.806781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  22 
 
 		 177 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.57 
 
 		 175 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  28.12 
 
 		 158 aa  50.1  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.87 
 
 		 164 aa  50.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  24 
 
 		 167 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.86 
 
 		 168 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.25 
 
 		 150 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  24 
 
 		 167 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  24 
 
 		 167 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  20.13 
 
 		 152 aa  49.7  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.85 
 
 		 177 aa  49.7  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  24 
 
 		 167 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.73 
 
 		 194 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.08 
 
 		 252 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  28.79 
 
 		 162 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  29.73 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  20.93 
 
 		 164 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  29.73 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.37 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  29.73 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.84 
 
 		 158 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  25.68 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.09 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.68 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.37 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  27.37 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  28.38 
 
 		 163 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  30.91 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  26.8 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.87 
 
 		 147 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.73 
 
 		 164 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.84 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  23.75 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  28.72 
 
 		 169 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.62 
 
 		 167 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  25.49 
 
 		 174 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 		 175 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.03 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.26 
 
 		 163 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 		 175 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  22.31 
 
 		 223 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.61 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 		 174 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 		 175 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  23.45 
 
 		 189 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.85 
 
 		 159 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.17 
 
 		 161 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  23.23 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  23.4 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  23.28 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  22.6 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  45.24 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  20.74 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.5 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.5 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  30.43 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  31.75 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.65 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>