More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16461 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
163 aa  335  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0143  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  60.65 
 
 
155 aa  210  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07751  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  59.35 
 
 
155 aa  208  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal  0.0539012 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10241  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  64.9 
 
 
165 aa  207  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.237232 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1262  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  70.34 
 
 
147 aa  207  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  67.88 
 
 
174 aa  194  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10011  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  54.79 
 
 
165 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0882  tRNA-adenosine deaminase  54.86 
 
 
171 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09421  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  55.94 
 
 
145 aa  183  8e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.362646  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09411  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  53.47 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  48.61 
 
 
156 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.14 
 
 
162 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.15 
 
 
154 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.15 
 
 
154 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  44.76 
 
 
147 aa  147  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.15 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.14 
 
 
174 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  47.55 
 
 
153 aa  135  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  41.78 
 
 
160 aa  134  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  43.05 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  49.65 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.52 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.06 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.75 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  43.33 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.14 
 
 
156 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  46.15 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  42.76 
 
 
159 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  43.85 
 
 
153 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.85 
 
 
154 aa  124  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.76 
 
 
151 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  41.06 
 
 
152 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
182 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.7 
 
 
156 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.17 
 
 
158 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.52 
 
 
190 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.96 
 
 
157 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.5 
 
 
223 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.31 
 
 
148 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  46.51 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  39.73 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.85 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  40.14 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.38 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  39.87 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.1 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.06 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  47.73 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.1 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.15 
 
 
153 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  42.38 
 
 
182 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  44.29 
 
 
177 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.1 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.61 
 
 
177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  40.41 
 
 
200 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  42.45 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 
166 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
161 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  42.47 
 
 
164 aa  117  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  40.41 
 
 
200 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  37.16 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.86 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  39.24 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.24 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  39.24 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.85 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  42.76 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  39.24 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  42.76 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  39.24 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  40.41 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  39.24 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.36 
 
 
168 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.58 
 
 
164 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  42.18 
 
 
172 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.58 
 
 
190 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  42.18 
 
 
172 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  38.61 
 
 
167 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.36 
 
 
189 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  43.85 
 
 
170 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  42.18 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.51 
 
 
168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  42.18 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  41.94 
 
 
168 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  42.18 
 
 
172 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  40 
 
 
169 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.73 
 
 
175 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.17 
 
 
154 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  40.69 
 
 
165 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  42.47 
 
 
171 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.69 
 
 
165 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.28 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  39.73 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.97 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.52 
 
 
231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  39.73 
 
 
222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.87 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.87 
 
 
182 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>