More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10241 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_10241  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
165 aa  341  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.237232 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  64.9 
 
 
163 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0143  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  62.24 
 
 
155 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07751  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  61.54 
 
 
155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal  0.0539012 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1262  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  62.76 
 
 
147 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10011  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  57.05 
 
 
165 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09411  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  57.79 
 
 
171 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09421  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  59.59 
 
 
145 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.362646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0882  tRNA-adenosine deaminase  57.42 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  64.03 
 
 
174 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  44.3 
 
 
149 aa  134  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  40.56 
 
 
147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  38.82 
 
 
153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.61 
 
 
153 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  39.73 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  37.67 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  41.61 
 
 
168 aa  124  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.55 
 
 
174 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  42.66 
 
 
153 aa  123  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.44 
 
 
162 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 
152 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.76 
 
 
165 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  41.96 
 
 
144 aa  121  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.73 
 
 
166 aa  120  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  37.82 
 
 
160 aa  120  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.73 
 
 
156 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  39.22 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.86 
 
 
183 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.15 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  38.1 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  39.46 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  40.13 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  40.69 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  40.13 
 
 
172 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40 
 
 
168 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  39.47 
 
 
178 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.62 
 
 
156 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  40.13 
 
 
172 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  40.13 
 
 
172 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  40.13 
 
 
172 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  39.47 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.47 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  39.47 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  39.47 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.86 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  39.47 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  39.47 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  39.47 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  40.28 
 
 
150 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  40.14 
 
 
168 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.73 
 
 
154 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  37.82 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.75 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  38.82 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  36.99 
 
 
158 aa  113  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 
168 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  37.58 
 
 
167 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.73 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.55 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.93 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.36 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.09 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  37.41 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.69 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  38 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.99 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.41 
 
 
169 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.49 
 
 
175 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.01 
 
 
168 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  36.05 
 
 
161 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.04 
 
 
223 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.99 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.76 
 
 
175 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.4 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.91 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  37.66 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.41 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.73 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  38.1 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  37.66 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.46 
 
 
363 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.84 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.31 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  37.91 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  37.66 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  36.73 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.05 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.57 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.54 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  38.36 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.27 
 
 
231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.85 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.9 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>