More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1262 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1262  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  76.47 
 
 
174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  70.34 
 
 
163 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0143  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  60.84 
 
 
155 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07751  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  60.14 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal  0.0539012 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10241  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  62.76 
 
 
165 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.237232 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0882  tRNA-adenosine deaminase  55.17 
 
 
171 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09411  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  54.48 
 
 
171 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10011  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  54.48 
 
 
165 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09421  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  54.48 
 
 
145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.362646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  47.26 
 
 
147 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.21 
 
 
165 aa  147  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
154 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
154 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  46.15 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.85 
 
 
162 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  45.52 
 
 
153 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.21 
 
 
166 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  47.55 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.36 
 
 
174 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  48.46 
 
 
153 aa  133  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  41.78 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.46 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.52 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  40.14 
 
 
160 aa  130  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.36 
 
 
148 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.06 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.83 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.15 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  46.21 
 
 
168 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  48.85 
 
 
169 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  47.69 
 
 
150 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.85 
 
 
154 aa  124  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  44.06 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
157 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.38 
 
 
152 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  43.75 
 
 
159 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.19 
 
 
154 aa  123  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.18 
 
 
158 aa  123  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.14 
 
 
156 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.36 
 
 
166 aa  121  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  43.75 
 
 
153 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  46.92 
 
 
159 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  41.78 
 
 
172 aa  120  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  44.06 
 
 
144 aa  120  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.68 
 
 
190 aa  120  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  46.92 
 
 
172 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  46.92 
 
 
172 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  46.92 
 
 
172 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.58 
 
 
148 aa  120  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  46.92 
 
 
172 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  46.92 
 
 
172 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  44.62 
 
 
178 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.38 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.04 
 
 
223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.07 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  44.76 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.73 
 
 
161 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  44.37 
 
 
171 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  42.07 
 
 
166 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  42.07 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.07 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.07 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  42.07 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  42.07 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  43.85 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.67 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  40.15 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  42.07 
 
 
166 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.41 
 
 
164 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  43.85 
 
 
178 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.85 
 
 
167 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  43.85 
 
 
178 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  43.85 
 
 
167 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  43.85 
 
 
167 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  43.85 
 
 
178 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.97 
 
 
168 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  43.85 
 
 
178 aa  116  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.67 
 
 
160 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.04 
 
 
150 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  40.69 
 
 
151 aa  116  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  43.36 
 
 
168 aa  116  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.4 
 
 
165 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.04 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.85 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  42.07 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.14 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.96 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  41.38 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.96 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  46.21 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.56 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  41.38 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>