62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1424 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  100 
 
 		 150 aa  309  9e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  66 
 
 		 151 aa  208  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  69.01 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  60.96 
 
 		 162 aa  184  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  71.43 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  58.5 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  56.95 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  32.11 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2004  nuclear protein SET  35.4 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216371  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1319  nuclear protein SET  34.65 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0784  nuclear protein SET  33.98 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.348835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0660  nuclear protein SET  33.93 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.388607  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_7553  predicted protein  30.77 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  30 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  30 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  30 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  28.28 
 
 		 634 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  30.71 
 
 		 1987 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0031  SET domain protein  32.35 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  31.5 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  33.33 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  31.37 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  31.67 
 
 		 230 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  33.33 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  32.5 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  31.09 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45088  predicted protein  29.68 
 
 		 491 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48313  predicted protein  26.32 
 
 		 616 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00387548  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45293  predicted protein  28.35 
 
 		 533 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  30.51 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  32.74 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0979  nuclear protein SET  31.2 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44525  predicted protein  28.35 
 
 		 544 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04270  hypothetical protein  30 
 
 		 647 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0242249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  26.77 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  27.56 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  30.51 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44421  predicted protein  27.41 
 
 		 1206 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  30.51 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  30.51 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  32.48 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  30.51 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  32.17 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  30.51 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  29.66 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47891  predicted protein  25.3 
 
 		 867 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  30.51 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  30.51 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  29.66 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46010  predicted protein  27.97 
 
 		 511 aa  40.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  37.88 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  37.88 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  31.36 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  28.81 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  31.36 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  28.06 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44270  predicted protein  26.53 
 
 		 628 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000597333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>