17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42590 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  100 
 
 
634 aa  1315    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42606  predicted protein  30.93 
 
 
630 aa  307  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44421  predicted protein  29.84 
 
 
1206 aa  236  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48313  predicted protein  29.45 
 
 
616 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00387548  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44271  predicted protein  28.14 
 
 
645 aa  203  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166766  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45722  predicted protein  26.1 
 
 
725 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454652  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49977  predicted protein  33.24 
 
 
578 aa  189  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46010  predicted protein  28.57 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44270  predicted protein  26.09 
 
 
628 aa  173  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000597333  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45293  predicted protein  31.79 
 
 
533 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47891  predicted protein  29.61 
 
 
867 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44525  predicted protein  30.62 
 
 
544 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  30.43 
 
 
1987 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45034  predicted protein  27.16 
 
 
510 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000346108  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48986  predicted protein  34.01 
 
 
780 aa  97.4  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212734  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  28.28 
 
 
150 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  26.75 
 
 
151 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>