16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44271 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44271  predicted protein  100 
 
 
645 aa  1344    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166766  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45722  predicted protein  39.74 
 
 
725 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454652  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44270  predicted protein  35.43 
 
 
628 aa  342  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000597333  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48313  predicted protein  35.3 
 
 
616 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00387548  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46010  predicted protein  34.81 
 
 
511 aa  264  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44421  predicted protein  30.76 
 
 
1206 aa  244  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  28.14 
 
 
634 aa  203  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42606  predicted protein  27.9 
 
 
630 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47891  predicted protein  31.64 
 
 
867 aa  174  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45293  predicted protein  31.9 
 
 
533 aa  164  6e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49977  predicted protein  31.88 
 
 
578 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  25.86 
 
 
1987 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44525  predicted protein  30.05 
 
 
544 aa  144  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45034  predicted protein  28.76 
 
 
510 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000346108  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48986  predicted protein  36.45 
 
 
780 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212734  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44967  predicted protein  26.04 
 
 
512 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>