17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45293 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45293  predicted protein  100 
 
 
533 aa  1116    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44525  predicted protein  46.97 
 
 
544 aa  508  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49977  predicted protein  28.44 
 
 
578 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44421  predicted protein  28.69 
 
 
1206 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45722  predicted protein  32.31 
 
 
725 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454652  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44270  predicted protein  33.15 
 
 
628 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000597333  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48313  predicted protein  34.81 
 
 
616 aa  173  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00387548  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47891  predicted protein  28.08 
 
 
867 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44271  predicted protein  31.9 
 
 
645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166766  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46010  predicted protein  30.03 
 
 
511 aa  153  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  31.79 
 
 
634 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42606  predicted protein  29.38 
 
 
630 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  27.88 
 
 
1987 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48986  predicted protein  27.91 
 
 
780 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212734  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45034  predicted protein  31.48 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000346108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  28.89 
 
 
151 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  28.35 
 
 
150 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>