15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42606 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42606  predicted protein  100 
 
 
630 aa  1314    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  30.93 
 
 
634 aa  307  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44421  predicted protein  29.56 
 
 
1206 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44271  predicted protein  27.9 
 
 
645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166766  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45722  predicted protein  27.4 
 
 
725 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454652  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48313  predicted protein  27.3 
 
 
616 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00387548  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49977  predicted protein  32.34 
 
 
578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46010  predicted protein  29.35 
 
 
511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44270  predicted protein  27.13 
 
 
628 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000597333  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47891  predicted protein  30.33 
 
 
867 aa  160  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45293  predicted protein  29.38 
 
 
533 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  26.09 
 
 
1987 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44525  predicted protein  25.85 
 
 
544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48986  predicted protein  31.88 
 
 
780 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212734  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45034  predicted protein  26.85 
 
 
510 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000346108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>