110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0004 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  100 
 
 		 164 aa  337  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  95.09 
 
 		 163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  64.47 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  63.16 
 
 		 179 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  63.51 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  64.43 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  59.51 
 
 		 172 aa  204  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  60.14 
 
 		 303 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  59.06 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  59.06 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  59.06 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  59.06 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  59.06 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  59.06 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  59.06 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  59.73 
 
 		 174 aa  194  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  58.39 
 
 		 174 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  58.44 
 
 		 230 aa  193  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  61.38 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  57.05 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  59.31 
 
 		 178 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  56.52 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  59.31 
 
 		 178 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  57.05 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  57.05 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  57.05 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  56.38 
 
 		 177 aa  190  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  56.13 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  52.94 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  53.06 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  53.74 
 
 		 213 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  53.06 
 
 		 213 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  53.74 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  51.7 
 
 		 252 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  54.29 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  49.35 
 
 		 210 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  46.9 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  49.66 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  45.27 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  44.83 
 
 		 146 aa  147  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  46 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  45.27 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  46.62 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  44.59 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  44.59 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  39.1 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  40.43 
 
 		 144 aa  94  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  35.97 
 
 		 1055 aa  93.2  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  35.42 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  35.46 
 
 		 503 aa  88.2  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  35.46 
 
 		 503 aa  88.2  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  36.11 
 
 		 812 aa  85.1  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  31.06 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  33.81 
 
 		 1220 aa  84  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  32.85 
 
 		 1469 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  34.31 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  33.11 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  30.77 
 
 		 860 aa  77  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  31.25 
 
 		 495 aa  75.5  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  30.56 
 
 		 980 aa  72.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  31.74 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  35.34 
 
 		 980 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  27.78 
 
 		 1782 aa  71.6  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  37.74 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  33.1 
 
 		 732 aa  70.9  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  39.81 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  31.85 
 
 		 834 aa  68.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  39.81 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  34.65 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  37.8 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  30.46 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  33.79 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  30.67 
 
 		 454 aa  64.3  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  36.8 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  28.87 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  32 
 
 		 551 aa  62  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  31.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00900  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1683  hypothetical protein  30.43 
 
 		 561 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  27.92 
 
 		 1361 aa  57.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44935  predicted protein  28.75 
 
 		 2187 aa  58.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1682  hypothetical protein  29.71 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  30.71 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  32.8 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  26.76 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1432  nuclear protein SET  25.36 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0947387  hitchhiker  0.0000000518275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1311  hypothetical protein  31.17 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.443859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32372  predicted protein  26.71 
 
 		 931 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  27.97 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  29.17 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  30.08 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1535  hypothetical protein  28.93 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00720131  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  30.89 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00219  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09180)  37.5 
 
 		 598 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  28.68 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0979  nuclear protein SET  27.97 
 
 		 207 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  32.74 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1893  nuclear protein SET  29.13 
 
 		 131 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2656  hypothetical protein  30.36 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>