100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0072 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  99.44 
 
 
178 aa  361  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  88.2 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  88.2 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  88.2 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  87.64 
 
 
176 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  92.67 
 
 
177 aa  297  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  88.74 
 
 
303 aa  291  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  88.08 
 
 
187 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  88.08 
 
 
187 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  87.42 
 
 
187 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  87.42 
 
 
187 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  87.42 
 
 
170 aa  284  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  87.42 
 
 
170 aa  284  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  87.42 
 
 
170 aa  284  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  70.79 
 
 
174 aa  260  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  78.81 
 
 
174 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  79.05 
 
 
160 aa  251  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  72.97 
 
 
170 aa  236  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  72.41 
 
 
172 aa  234  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  70.2 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  70 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  70 
 
 
179 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  68.92 
 
 
230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  64.78 
 
 
177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  67.83 
 
 
173 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  66.67 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  68.06 
 
 
159 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  65.54 
 
 
210 aa  210  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  59.32 
 
 
252 aa  207  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  66.21 
 
 
213 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  67.13 
 
 
213 aa  205  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  66.43 
 
 
184 aa  203  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  60.81 
 
 
163 aa  194  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  58.78 
 
 
164 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  58.9 
 
 
149 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  59.7 
 
 
163 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  55.94 
 
 
146 aa  174  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  54.42 
 
 
150 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  55.24 
 
 
146 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  50.99 
 
 
155 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  50.99 
 
 
155 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  49.36 
 
 
155 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  46.36 
 
 
155 aa  140  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  40.13 
 
 
158 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  37.5 
 
 
1055 aa  95.9  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  38.36 
 
 
1220 aa  94.4  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  39.31 
 
 
223 aa  94.4  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  37.32 
 
 
139 aa  91.7  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  36.77 
 
 
159 aa  91.7  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  40.14 
 
 
860 aa  88.6  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  42.31 
 
 
230 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  35.12 
 
 
503 aa  81.6  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  35.12 
 
 
503 aa  81.6  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  40.38 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  37.5 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  33.11 
 
 
495 aa  77.4  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  36.23 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  32.48 
 
 
551 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  35.51 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  35.16 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  30.87 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 
1469 aa  75.1  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  33.1 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  36.17 
 
 
144 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  31.51 
 
 
1782 aa  72.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  34.62 
 
 
250 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  31.33 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  32.12 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  40.57 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  35.97 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  31.65 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  35.34 
 
 
980 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238798 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  29.17 
 
 
980 aa  62.8  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  30.37 
 
 
834 aa  60.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  29.49 
 
 
454 aa  58.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  30.28 
 
 
732 aa  58.5  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.418717 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  32.64 
 
 
812 aa  57.8  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00900  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 
380 aa  55.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0979  nuclear protein SET  32.43 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  29.58 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  32.69 
 
 
1361 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  36.84 
 
 
219 aa  51.2  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44935  predicted protein  30 
 
 
2187 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19605  predicted protein  38.03 
 
 
375 aa  49.3  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1893  nuclear protein SET  32.46 
 
 
131 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32372  predicted protein  27.5 
 
 
931 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44204  predicted protein  29.73 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  35.04 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1494  nuclear protein SET  38.1 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4772  hypothetical protein  34.21 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0850  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.551417  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2167  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000015982  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  30.77 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1861  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1447  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.458339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0536  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103819  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0439  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0695919  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2089  hypothetical protein  33.77 
 
 
172 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>