38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0979 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0979  nuclear protein SET  100 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  29.21 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  32.43 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  32.43 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  29.46 
 
 		 303 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  31.53 
 
 		 177 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  28.68 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  28.68 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  32.17 
 
 		 860 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87957  predicted protein  30.89 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  28.68 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  28.68 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  30.63 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  29.6 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  28.57 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  28.57 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  28.57 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  30.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  32.43 
 
 		 160 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  30.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  30.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  33.93 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0949  hypothetical protein  26.75 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000549619  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  24.55 
 
 		 106 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  33.04 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  32.14 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  29.46 
 
 		 245 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1683  hypothetical protein  25.32 
 
 		 561 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  27.97 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  33.93 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  26.05 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  27.97 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  31.2 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  31.25 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  28.75 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  29.06 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  29.73 
 
 		 980 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  28.57 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>