63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1482 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  100 
 
 
156 aa  322  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  64.94 
 
 
156 aa  223  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  60 
 
 
151 aa  187  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  71.43 
 
 
150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  56.34 
 
 
155 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  56.29 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  61.11 
 
 
154 aa  163  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  35.04 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0660  nuclear protein SET  33.6 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.388607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2004  nuclear protein SET  35.9 
 
 
129 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216371  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_7553  predicted protein  33.65 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  36.36 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  36.36 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  36.36 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  36.36 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  36.36 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  36.36 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  36.36 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  36.36 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  36.27 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0784  nuclear protein SET  32.17 
 
 
132 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.348835  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1319  nuclear protein SET  30.69 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0031  SET domain protein  36.36 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  35.35 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  31.2 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  31.3 
 
 
245 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  30.4 
 
 
230 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  30.89 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  32.17 
 
 
213 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  30.65 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  29.23 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  29.92 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  30.51 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  30.89 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  30.71 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  25 
 
 
634 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  32.17 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  29.41 
 
 
230 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  35 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  29.31 
 
 
252 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  29.77 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  34.06 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  34.06 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04270  hypothetical protein  27.27 
 
 
647 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0242249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  34.06 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  34.06 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44525  predicted protein  27.94 
 
 
544 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  33.62 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  27.2 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  32.5 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  32.5 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  27.41 
 
 
495 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  33.63 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  33.63 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  33.63 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  31.78 
 
 
1220 aa  40.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  27.83 
 
 
173 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  29.57 
 
 
197 aa  40.8  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  31.67 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92854  predicted protein  38.18 
 
 
639 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798313  normal  0.0275457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  31.67 
 
 
174 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  33.33 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>