107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3358 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  83.24 
 
 		 179 aa  306  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  83.8 
 
 		 179 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  78.38 
 
 		 170 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  71.1 
 
 		 172 aa  257  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  71.62 
 
 		 174 aa  235  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  70.95 
 
 		 174 aa  235  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  73.61 
 
 		 160 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  70.95 
 
 		 187 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  70.95 
 
 		 187 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  70.95 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  70.27 
 
 		 303 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  70.95 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  70.95 
 
 		 170 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  70.95 
 
 		 170 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  70.95 
 
 		 170 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  72.22 
 
 		 178 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  72.22 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  69.86 
 
 		 176 aa  227  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  69.18 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  69.18 
 
 		 176 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  69.18 
 
 		 176 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  69.18 
 
 		 176 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  67.81 
 
 		 230 aa  224  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  60.12 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  69.93 
 
 		 173 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  59.06 
 
 		 213 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  64.9 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  64.47 
 
 		 164 aa  208  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  66.22 
 
 		 163 aa  207  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  59.06 
 
 		 184 aa  204  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  64.34 
 
 		 213 aa  204  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  64.34 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  61.54 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  57.06 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  60 
 
 		 163 aa  184  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  54.11 
 
 		 150 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  55.17 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  51.41 
 
 		 146 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  52.11 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  48 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  49.68 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  49.34 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  49.34 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  47.47 
 
 		 155 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  40.94 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  38.26 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  36.24 
 
 		 1055 aa  95.5  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  35.67 
 
 		 223 aa  88.2  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  34.9 
 
 		 1220 aa  88.2  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  36.62 
 
 		 139 aa  84.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  40.54 
 
 		 144 aa  84.3  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  37.41 
 
 		 503 aa  82.8  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  37.41 
 
 		 503 aa  82.8  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  33.33 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  40 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  35.09 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  33.33 
 
 		 860 aa  79  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  34 
 
 		 495 aa  79  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  40.38 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  43.81 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  32.89 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  36.36 
 
 		 980 aa  75.1  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 1469 aa  74.7  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  33.09 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  28.97 
 
 		 1782 aa  73.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  40.38 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  30.95 
 
 		 551 aa  68.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  38.46 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  32 
 
 		 980 aa  67.8  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  31.85 
 
 		 834 aa  67  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  37.5 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  37.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  32 
 
 		 732 aa  67  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  33.65 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  29.5 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  32.26 
 
 		 812 aa  65.1  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  31.29 
 
 		 454 aa  64.3  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  32.69 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  28.47 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00900  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2656  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1311  hypothetical protein  40.3 
 
 		 133 aa  50.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.443859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  33.97 
 
 		 1361 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  32.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32372  predicted protein  30.56 
 
 		 931 aa  48.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1447  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.458339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1861  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2167  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000015982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0536  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103819  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0439  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0695919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0850  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.551417  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  35.14 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  29.91 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19605  predicted protein  40.28 
 
 		 375 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2089  hypothetical protein  28.35 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0949  hypothetical protein  29.27 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000549619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1893  nuclear protein SET  32.41 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  28.57 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44935  predicted protein  31.71 
 
 		 2187 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>