87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32740 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  100 
 
 
1055 aa  2171    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  54.26 
 
 
1220 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  45.76 
 
 
1469 aa  214  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  51.77 
 
 
154 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  56.78 
 
 
141 aa  138  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  45.71 
 
 
139 aa  129  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  42.14 
 
 
1782 aa  124  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  37.12 
 
 
834 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  37.69 
 
 
860 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  34.75 
 
 
980 aa  99.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  35.26 
 
 
503 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  35.26 
 
 
503 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  37.14 
 
 
172 aa  98.6  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  35.17 
 
 
495 aa  97.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  37.5 
 
 
176 aa  96.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  39.29 
 
 
159 aa  97.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  37.5 
 
 
184 aa  96.3  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  38.57 
 
 
230 aa  95.9  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  36.81 
 
 
176 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  36.24 
 
 
179 aa  95.1  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  36.81 
 
 
176 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  36.81 
 
 
176 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  37.86 
 
 
213 aa  94.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  37.86 
 
 
213 aa  94.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  35.17 
 
 
149 aa  94.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  36.69 
 
 
146 aa  94.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  33.14 
 
 
179 aa  93.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  94  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  35.97 
 
 
164 aa  92.8  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  35.42 
 
 
170 aa  92.8  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  37.23 
 
 
163 aa  92.8  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  38.57 
 
 
177 aa  92.8  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  36.69 
 
 
163 aa  92.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  35.25 
 
 
146 aa  92  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  36.92 
 
 
164 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  37.5 
 
 
160 aa  91.3  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  37.5 
 
 
178 aa  91.3  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  32.56 
 
 
179 aa  90.5  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  37.5 
 
 
178 aa  90.9  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  36.42 
 
 
155 aa  90.5  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  36.43 
 
 
252 aa  90.9  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  36.81 
 
 
174 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  37.14 
 
 
170 aa  88.6  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  37.14 
 
 
170 aa  88.6  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  37.14 
 
 
170 aa  88.6  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  37.59 
 
 
155 aa  88.6  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  37.59 
 
 
155 aa  88.6  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  37.14 
 
 
187 aa  88.6  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  37.14 
 
 
187 aa  88.6  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  34.72 
 
 
177 aa  88.2  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  34.93 
 
 
144 aa  88.2  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  37.14 
 
 
187 aa  87.8  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  37.14 
 
 
187 aa  87.8  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  36 
 
 
179 aa  87.4  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  41.12 
 
 
106 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15913  predicted protein  45.45 
 
 
107 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  36.67 
 
 
173 aa  87.4  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  36.6 
 
 
155 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  35 
 
 
160 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  30.52 
 
 
303 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  32.39 
 
 
812 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  36.11 
 
 
210 aa  83.2  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  32.62 
 
 
732 aa  82  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.418717 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  35.14 
 
 
551 aa  82  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  31.75 
 
 
980 aa  81.3  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  35.42 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  38.73 
 
 
139 aa  80.9  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  36.11 
 
 
223 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  36.81 
 
 
159 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  34.67 
 
 
158 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  31.67 
 
 
245 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  32.33 
 
 
196 aa  68.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  31.58 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  27.92 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  31.85 
 
 
251 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  28.15 
 
 
300 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  32.59 
 
 
197 aa  64.3  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44935  predicted protein  32.89 
 
 
2187 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00900  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 
380 aa  62  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  27.82 
 
 
250 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  28.99 
 
 
159 aa  60.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1432  nuclear protein SET  29.32 
 
 
242 aa  53.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0947387  hitchhiker  0.0000000518275 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32372  predicted protein  29.49 
 
 
931 aa  52.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  34.86 
 
 
219 aa  47.4  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44204  predicted protein  38.24 
 
 
219 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01150  polycomb protein e(z), putative  30.16 
 
 
717 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  32.26 
 
 
1361 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>