74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0731 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  100 
 
 		 161 aa  329  9e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  27.4 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  29.49 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  28.08 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  29.53 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  30 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  29.86 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  28.24 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  27.4 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  28.77 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  28.28 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  27.06 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  30.56 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  29.17 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  28.85 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  28.28 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  28.17 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  26.76 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  29.58 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  29.38 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  29.58 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  29.58 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  29.58 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  29.58 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  29.49 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  24.16 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  28.87 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  31.11 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  29.69 
 
 		 245 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  30.23 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  28.48 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  28.87 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  28.46 
 
 		 251 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  27.46 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  27.46 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  28.87 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  27.46 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  28.87 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  27.46 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  28.87 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  26.21 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 		 1469 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  28.21 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  32.58 
 
 		 1220 aa  48.5  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  28.78 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  26.21 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  30.34 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  29.77 
 
 		 230 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  30.5 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4772  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  28.95 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  26.92 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  29.45 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  26.28 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  26.96 
 
 		 250 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  25.52 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  26.67 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  25.93 
 
 		 1055 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  28.17 
 
 		 860 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00900  conserved hypothetical protein  31.86 
 
 		 380 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  25.58 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  25 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  27.45 
 
 		 223 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  28.8 
 
 		 156 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  23.97 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2089  hypothetical protein  23.08 
 
 		 172 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1494  nuclear protein SET  26.15 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  27.54 
 
 		 495 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  27.73 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  32.43 
 
 		 551 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  30.67 
 
 		 1782 aa  40.8  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  26.54 
 
 		 454 aa  40.8  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>