88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1714 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  100 
 
 		 300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  73.22 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  78.62 
 
 		 197 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  87.22 
 
 		 251 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  64.78 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  73.58 
 
 		 196 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  63.55 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  33.59 
 
 		 155 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  34.38 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  36.09 
 
 		 155 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  35.65 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  36.09 
 
 		 155 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  34.23 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  36.19 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  34.51 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  34.51 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  34.38 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  34.29 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  31.71 
 
 		 173 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  36.19 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  41.41 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  30.4 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  33.33 
 
 		 860 aa  73.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  34.29 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  32.71 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  33.33 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  32 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  35.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  35.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  35.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  33.66 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  38.1 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  31.71 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  30.38 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  34.29 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  34.29 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  33.33 
 
 		 160 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  30.83 
 
 		 1220 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  34.29 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 1469 aa  66.2  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  31.43 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  32.79 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  32.79 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  32.79 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  31.43 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  34.29 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  31.43 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  34.29 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  34.29 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  32.79 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  34.29 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  27.86 
 
 		 1055 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  30.25 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  32.06 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  31.25 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  32.58 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  31.43 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  35.34 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  34.51 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  32.73 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  30.08 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  32.17 
 
 		 980 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  29.91 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  31.73 
 
 		 150 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  25.87 
 
 		 980 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  31.01 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  27.91 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  31.82 
 
 		 495 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  27.42 
 
 		 454 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  26.5 
 
 		 834 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  33.33 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  25.68 
 
 		 812 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  29.49 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  29.91 
 
 		 1782 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01150  polycomb protein e(z), putative  27.87 
 
 		 717 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  26.96 
 
 		 551 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  29.66 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  29 
 
 		 197 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  29.58 
 
 		 161 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00219  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09180)  35.29 
 
 		 598 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1883  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  32.28 
 
 		 1308 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814952  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  27.88 
 
 		 106 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93480  predicted protein  32 
 
 		 136 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.570428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1535  hypothetical protein  30.19 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00720131  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  26.02 
 
 		 164 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44204  predicted protein  27.97 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0979  nuclear protein SET  26.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>