18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2656 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2656  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  291  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0949  hypothetical protein  62.12 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000549619  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93480  predicted protein  30.58 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.570428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  31.5 
 
 
179 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  31.5 
 
 
179 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  32.79 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  29.25 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1535  hypothetical protein  33.04 
 
 
194 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00720131  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1683  hypothetical protein  26.32 
 
 
561 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1682  hypothetical protein  26.52 
 
 
561 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  32.14 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  29.29 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  28.99 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  25.93 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  30.36 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  27.27 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  31.25 
 
 
150 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>