28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1535 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00720131  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  32.71 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  32.08 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  34.58 
 
 		 860 aa  48.5  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  28.7 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2656  hypothetical protein  33.04 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  27.83 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93480  predicted protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.570428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  28.04 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  27.36 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  27.27 
 
 		 300 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  31.13 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  30.19 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  32.41 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  29.75 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  30.43 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  28.04 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  30.56 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  31.13 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  30.56 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  31.86 
 
 		 1055 aa  42.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  28.97 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  29.73 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  30.33 
 
 		 155 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  27.78 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>