98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0820 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  100 
 
 
155 aa  322  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  322  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  74.19 
 
 
155 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  71.61 
 
 
155 aa  243  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  50.65 
 
 
172 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  49.35 
 
 
184 aa  153  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  50.33 
 
 
174 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  48.7 
 
 
170 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  50.33 
 
 
174 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  47.4 
 
 
213 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  50.99 
 
 
178 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  48.05 
 
 
213 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  50.99 
 
 
178 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  46.75 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  50.33 
 
 
179 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  50.33 
 
 
179 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  46.1 
 
 
252 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  47.74 
 
 
179 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  49.67 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  47.74 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  49.67 
 
 
177 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  49.34 
 
 
179 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
303 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
187 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
187 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
187 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  49.01 
 
 
176 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  45.1 
 
 
177 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  49.01 
 
 
176 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  47.37 
 
 
210 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
187 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  49.01 
 
 
176 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
170 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
170 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  49.67 
 
 
170 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  44.44 
 
 
230 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  49.01 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  46.21 
 
 
163 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  44.59 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  45.27 
 
 
163 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  43.62 
 
 
149 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  44.3 
 
 
150 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  40.94 
 
 
146 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  42 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  39.6 
 
 
146 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.054698 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  41.43 
 
 
1220 aa  93.6  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  37.59 
 
 
1055 aa  89  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  40.62 
 
 
230 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  35.1 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  37.67 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  38.46 
 
 
245 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  39.85 
 
 
251 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  38.19 
 
 
223 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  33.57 
 
 
1469 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  34.48 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  36.84 
 
 
197 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  36.92 
 
 
196 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  36.09 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  36.15 
 
 
250 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  31.69 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  33.56 
 
 
1782 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  33.33 
 
 
860 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  33.87 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  36.36 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  36.36 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  37.96 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  32.62 
 
 
834 aa  67  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  29.79 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  32.64 
 
 
732 aa  65.5  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  30.2 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0196286 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  30.2 
 
 
551 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  26.53 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  29.37 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  33.55 
 
 
495 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  29.08 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  30.5 
 
 
980 aa  61.6  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  39.82 
 
 
219 aa  60.8  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  31.29 
 
 
812 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  30.97 
 
 
980 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  31.65 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00900  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 
380 aa  52.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709683  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01150  polycomb protein e(z), putative  28.33 
 
 
717 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19605  predicted protein  35.9 
 
 
375 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1893  nuclear protein SET  32.77 
 
 
131 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  35.63 
 
 
1361 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15913  predicted protein  35.71 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32372  predicted protein  31.4 
 
 
931 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  26.17 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44935  predicted protein  28.74 
 
 
2187 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5051  hypothetical protein  29.33 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1682  hypothetical protein  28.7 
 
 
561 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00219  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09180)  29.58 
 
 
598 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1683  hypothetical protein  29.63 
 
 
561 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1432  nuclear protein SET  22.56 
 
 
242 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0947387  hitchhiker  0.0000000518275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  28.33 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15174  predicted protein  25.18 
 
 
253 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000235527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  33.33 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  32.5 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>