48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_19605 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_19605  predicted protein  100 
 
 
375 aa  769    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10915  conserved hypothetical protein  38.14 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0251863  normal  0.0913567 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  34.82 
 
 
638 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92854  predicted protein  36.84 
 
 
639 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798313  normal  0.0275457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  42.86 
 
 
210 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05998  SET and MYND domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10080)  32.98 
 
 
497 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15174  predicted protein  37.04 
 
 
253 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000235527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  38.03 
 
 
252 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  33.82 
 
 
159 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  39.44 
 
 
160 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63965  predicted protein  41.33 
 
 
478 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43708  predicted protein  31.71 
 
 
501 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  38.03 
 
 
178 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  38.03 
 
 
178 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31845  predicted protein  34.18 
 
 
654 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03780  conserved hypothetical protein  30 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50541  predicted protein  25.93 
 
 
493 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  38.03 
 
 
174 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  39.44 
 
 
163 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06829  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12710)  30.56 
 
 
710 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.672401  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  38.03 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  35.21 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  36.62 
 
 
177 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  35.21 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  40.28 
 
 
179 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  35.21 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  38.36 
 
 
174 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  36.62 
 
 
176 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  35.9 
 
 
155 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  35.9 
 
 
155 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  40.28 
 
 
179 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
303 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  38.03 
 
 
213 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  38.89 
 
 
179 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
170 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
170 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  38.03 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  35.21 
 
 
177 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  35.21 
 
 
170 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  36.62 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  36.62 
 
 
159 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  32.39 
 
 
173 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  34.29 
 
 
170 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  34.62 
 
 
155 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>