108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3954 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  100 
 
 		 159 aa  333  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  82.24 
 
 		 213 aa  273  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  85.03 
 
 		 213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  75.61 
 
 		 177 aa  265  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  80.92 
 
 		 252 aa  265  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  81.7 
 
 		 184 aa  263  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  79.73 
 
 		 230 aa  262  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  73.29 
 
 		 173 aa  243  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  70.13 
 
 		 210 aa  235  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  74.64 
 
 		 163 aa  231  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  66.67 
 
 		 172 aa  225  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  70.55 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  71.53 
 
 		 170 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  66.9 
 
 		 174 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  66.9 
 
 		 174 aa  209  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  67.59 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  64.9 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  68.06 
 
 		 178 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  68.06 
 
 		 178 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  65.31 
 
 		 303 aa  207  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  67.36 
 
 		 176 aa  206  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  65.31 
 
 		 187 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  65.31 
 
 		 187 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  65.31 
 
 		 187 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  65.31 
 
 		 187 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  63.64 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  66.67 
 
 		 170 aa  203  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  66.67 
 
 		 170 aa  203  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  66.67 
 
 		 170 aa  203  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  66.67 
 
 		 176 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  66.67 
 
 		 176 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  66.67 
 
 		 176 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  66.67 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  62.94 
 
 		 179 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  55.78 
 
 		 163 aa  177  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  53.06 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  54.55 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  50 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  51.05 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  51.75 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  50.34 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  46.45 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  49.31 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  47.74 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  47.74 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  37.74 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  38.67 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  39.29 
 
 		 1055 aa  97.4  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  40.28 
 
 		 1220 aa  94  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  36.62 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  37.16 
 
 		 1469 aa  87  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  35.53 
 
 		 503 aa  86.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  35.53 
 
 		 503 aa  86.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  35.86 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  35.37 
 
 		 860 aa  84  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  32.67 
 
 		 154 aa  84  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  37.5 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  37.5 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  33.77 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  30.07 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  36.54 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  37.5 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  37.5 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  33.56 
 
 		 495 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  29.88 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  35.09 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  30.67 
 
 		 551 aa  72.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  31.79 
 
 		 732 aa  72  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  33.58 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  36.36 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  35 
 
 		 812 aa  70.5  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  34.21 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  29.68 
 
 		 980 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  27.81 
 
 		 1782 aa  68.2  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  40.57 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  30.57 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  35.45 
 
 		 980 aa  64.7  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  32.37 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  27.59 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  28.68 
 
 		 834 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  33.33 
 
 		 1361 aa  60.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1432  nuclear protein SET  28.57 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0947387  hitchhiker  0.0000000518275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1893  nuclear protein SET  30.7 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01150  polycomb protein e(z), putative  33.93 
 
 		 717 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32372  predicted protein  28.07 
 
 		 931 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  31.01 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  31.82 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0110  hypothetical protein  35.96 
 
 		 219 aa  47.4  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.805691  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44935  predicted protein  31.71 
 
 		 2187 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  29.91 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4772  hypothetical protein  35.06 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19605  predicted protein  36.62 
 
 		 375 aa  44.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1447  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.458339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1861  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2167  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000015982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0536  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103819  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0439  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0695919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0850  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.551417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1494  nuclear protein SET  34.92 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2089  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>