50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4772 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4772  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0536  hypothetical protein  49.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2167  hypothetical protein  49.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000015982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1447  hypothetical protein  49.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.458339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0439  hypothetical protein  49.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0695919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0850  hypothetical protein  49.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.551417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1861  hypothetical protein  49.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2089  hypothetical protein  49.66 
 
 		 172 aa  148  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1494  nuclear protein SET  37.96 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1261  nuclear protein SET  36.63 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.375429  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  40.3 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  36.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  39.68 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  26.62 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5051  hypothetical protein  28.3 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  36.84 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  41.27 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  36.84 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  38.1 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  37.14 
 
 		 303 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1311  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.443859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  36.36 
 
 		 177 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  35.06 
 
 		 159 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  36.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  36.62 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  36.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  36.51 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  38.16 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  36.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  36.62 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  36.62 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  36.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  36.84 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  39.68 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  36.84 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  36.84 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44204  predicted protein  36.36 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  39.66 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  35.06 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07208  conserved hypothetical protein  34.43 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  36.51 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  29.51 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  37.1 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  39.34 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  39.34 
 
 		 178 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  36.51 
 
 		 160 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  38.1 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  38.1 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  38.1 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88595  predicted protein  30.14 
 
 		 1361 aa  41.2  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116924  normal  0.0256987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>