53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44204 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44204  predicted protein  100 
 
 
219 aa  460  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1311  hypothetical protein  39.84 
 
 
133 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.443859  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1494  nuclear protein SET  31.03 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5051  hypothetical protein  32.63 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  31.82 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2089  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1447  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.458339  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0850  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.551417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1861  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0439  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0695919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0536  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2167  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000015982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1261  nuclear protein SET  24.8 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.375429  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07208  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 
188 aa  49.7  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  30.15 
 
 
144 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1432  nuclear protein SET  25.93 
 
 
242 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0947387  hitchhiker  0.0000000518275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  29.73 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  25.5 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  40.3 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  28.95 
 
 
230 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  38.24 
 
 
1055 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  37.88 
 
 
1220 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  24.84 
 
 
812 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  28 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  38.67 
 
 
551 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  27.21 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  28.38 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  30.41 
 
 
178 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  33.8 
 
 
139 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  27.97 
 
 
300 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  29.73 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  26.96 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  28.38 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  28.03 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  30.41 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  29.73 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
1469 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  29.31 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4772  hypothetical protein  36.36 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  29.73 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  29.73 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  29.73 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  29.37 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03230  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.561921  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  28.67 
 
 
154 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  26.75 
 
 
503 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  26.75 
 
 
503 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  37.33 
 
 
303 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  28.29 
 
 
210 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  27.97 
 
 
245 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  25.64 
 
 
250 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  24.52 
 
 
1782 aa  41.6  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  28.12 
 
 
179 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>