45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1432 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1432  nuclear protein SET  100 
 
 
242 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0947387  hitchhiker  0.0000000518275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1311  hypothetical protein  38.54 
 
 
133 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.443859  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1494  nuclear protein SET  38.39 
 
 
155 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  25.36 
 
 
164 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2167  hypothetical protein  31.07 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000015982  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  29.32 
 
 
1055 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0536  hypothetical protein  31.07 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103819  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0439  hypothetical protein  31.07 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0695919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0850  hypothetical protein  31.07 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.551417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1861  hypothetical protein  31.07 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1447  hypothetical protein  31.07 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.458339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  25.36 
 
 
163 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  28.57 
 
 
159 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2089  hypothetical protein  30.1 
 
 
172 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5051  hypothetical protein  34.62 
 
 
177 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  28.79 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  28.7 
 
 
1220 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  29.55 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  27.27 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  28.89 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  28.36 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  27.27 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  26.52 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  28.68 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44204  predicted protein  25.93 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1261  nuclear protein SET  34.52 
 
 
174 aa  48.9  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.375429  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  35.85 
 
 
149 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  28.36 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  28.79 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  27.27 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  27.86 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  29.07 
 
 
155 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  30.16 
 
 
163 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  30.08 
 
 
154 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  27.61 
 
 
174 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  29.93 
 
 
179 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  28.57 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  29.23 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  35.59 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  36.07 
 
 
160 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  29.32 
 
 
164 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  29.46 
 
 
179 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  26.72 
 
 
159 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  27.13 
 
 
146 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07208  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>