43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1126 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  60.67 
 
 
151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  57.89 
 
 
150 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  55.26 
 
 
156 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  56.03 
 
 
155 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  52.9 
 
 
156 aa  165  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  54.42 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2004  nuclear protein SET  30.51 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216371  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  33.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  33.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  33.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  33.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  33.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  33.05 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0660  nuclear protein SET  34.58 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.388607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  32.48 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0031  SET domain protein  31.62 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  33.04 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  27.97 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  27.91 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1319  nuclear protein SET  30.69 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  32.5 
 
 
213 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  32.73 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  31.82 
 
 
252 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  32.5 
 
 
213 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_7553  predicted protein  30.19 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0784  nuclear protein SET  26.32 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.348835  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  32.76 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  28.57 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  28.12 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  29.37 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  29.37 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  32.76 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  27.78 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  28.21 
 
 
634 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  33.93 
 
 
210 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  27.05 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  28.81 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>