94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2451 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2451  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 292 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.512934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3294  universal stress protein  78.38 
 
 		 296 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.949607  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3290  universal stress protein  38.85 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2468  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51316  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3029  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  31.94 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  30.67 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1667  universal stress protein family  33.5 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  30.16 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  29 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  30.67 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2890  UspA domain-containing protein  28.25 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  30.3 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2558  UspA domain-containing protein  27.69 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2699  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3156  universal stress protein  27.36 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3031  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3288  universal stress protein  31.28 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3347  hypothetical protein  29.95 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2470  UspA domain-containing protein  26.37 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  30.14 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  24.3 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  23.36 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  23.55 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  22.19 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  23.36 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  23.22 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  23.68 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  23.29 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  23.05 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0988  UspA domain-containing protein  21.64 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  23.29 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  23.18 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  25.48 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  25.58 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  25.16 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  29.53 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  28.65 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  28.65 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  28.65 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  28.65 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  28.65 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  28.65 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  24.23 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  28.65 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  28.65 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  26.89 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  30.67 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  24.32 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  27.6 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  25.38 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  27.6 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.25 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  25.31 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  27.75 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  28.12 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  28.12 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  28.12 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  28.12 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  23.86 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  28.12 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  20.26 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  24.92 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2103  hypothetical protein  24.27 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0483069  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  31.07 
 
 		 143 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  27.08 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  24.92 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  31.07 
 
 		 143 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  27.08 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3550  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  23.2 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  30.57 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  27.6 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  25.17 
 
 		 140 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0585  hypothetical protein  29.34 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723189  decreased coverage  0.000113105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  26.76 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  24.1 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>