125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0819 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  68.51 
 
 		 244 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  67.81 
 
 		 238 aa  331  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  67.81 
 
 		 238 aa  331  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  59.66 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  54.94 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  58.97 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  53.25 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  56.14 
 
 		 285 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  49.57 
 
 		 230 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  46.52 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  47.39 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  41.7 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  41.01 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  39.73 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  40.55 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  37.02 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  39.38 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  39.27 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  37.7 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  37.7 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  35.07 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  35.55 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  36.53 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  33.91 
 
 		 254 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  34.38 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  34.03 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  33.8 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  31.84 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  35.07 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  35.07 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  35.07 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  29.86 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  29.07 
 
 		 475 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  30.33 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  28.89 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  28.89 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  30.33 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  29.15 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  28.11 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  25.98 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  30.99 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  26.34 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  30.29 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  28.86 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  28.22 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  27.73 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  29.38 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  29.95 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  27.8 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  28.43 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  29.11 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  25.31 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  25.25 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  31.66 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  28.65 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  26.39 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  26.88 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0028  hypothetical protein  24.44 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  24.29 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  27.65 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  31.71 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  26.44 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0060  hypothetical membrane spanning protein  23.46 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  27.38 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  27.72 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  24.6 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  27.69 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  25.84 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  24.22 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  23.65 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  27.35 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  20.2 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  25.65 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  24.08 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  23.16 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  23.03 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  23.3 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  21.83 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  27.33 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  26.24 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  27.01 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  30.91 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  27.22 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  24.04 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  27.22 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  27.22 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  24.51 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  27.22 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  24.75 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  22.83 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  24.71 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  23.96 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>