143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4090 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  79.26 
 
 
219 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  83.57 
 
 
223 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  79.26 
 
 
219 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  79.26 
 
 
219 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  79.26 
 
 
219 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  82.46 
 
 
221 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  78.34 
 
 
222 aa  359  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  75.58 
 
 
226 aa  347  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  79.05 
 
 
219 aa  345  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  78.34 
 
 
219 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  75.34 
 
 
219 aa  344  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  78.8 
 
 
219 aa  341  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  78.6 
 
 
217 aa  337  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  78.6 
 
 
217 aa  337  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  78.6 
 
 
217 aa  337  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  76.67 
 
 
219 aa  331  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  66.51 
 
 
224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  65.55 
 
 
245 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  65.85 
 
 
223 aa  278  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  61.61 
 
 
227 aa  268  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  59.15 
 
 
221 aa  265  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  57.94 
 
 
236 aa  261  6.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  60.29 
 
 
224 aa  254  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  57.53 
 
 
221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  58.14 
 
 
223 aa  252  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  56.6 
 
 
225 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  58.06 
 
 
222 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  58.06 
 
 
222 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  58.62 
 
 
222 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  55.71 
 
 
221 aa  248  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  55.71 
 
 
221 aa  248  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  58.06 
 
 
222 aa  247  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  58.62 
 
 
222 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  56.94 
 
 
246 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  55.25 
 
 
221 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  55.25 
 
 
221 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  55.25 
 
 
221 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  55.25 
 
 
221 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  55.25 
 
 
221 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  55.25 
 
 
221 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  55.25 
 
 
221 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  55.66 
 
 
225 aa  244  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  58.41 
 
 
216 aa  244  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  56.87 
 
 
222 aa  244  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  60.3 
 
 
217 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  56.68 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  60.5 
 
 
218 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  48.15 
 
 
225 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  47.62 
 
 
225 aa  185  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  41.5 
 
 
216 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  42.07 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  33.17 
 
 
181 aa  99  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  33.93 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  35.29 
 
 
211 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  41.38 
 
 
208 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  41.84 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  32.55 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  34.67 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  30.73 
 
 
220 aa  94  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  38.93 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  36.5 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  32.34 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  32.99 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  31.43 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  32.1 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  30.61 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  30.61 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  29.1 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  29.45 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  29.85 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  33.08 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  27.57 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  30.39 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  29.38 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  26.17 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  30.16 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.99 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  27.75 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  27.01 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  26.85 
 
 
224 aa  58.2  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  25.62 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  25.62 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  27.91 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  27.36 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  32.69 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  32.69 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>