151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0135 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  44.61 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  47.57 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  41.45 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  42.41 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  43.24 
 
 		 185 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  40.3 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  39 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  40.62 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  37.7 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  37.67 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  35.47 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  37.89 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  36.82 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  38.84 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  36.55 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  34.5 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  32.8 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  33.67 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  38.71 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  35.75 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  37.74 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  35.23 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  32.31 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  32.81 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  32.88 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  29.68 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  32.39 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  33.5 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  34.29 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  111  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  33.17 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  34.64 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  34.64 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  31.32 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  31.71 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  37.1 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  31.28 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  33.5 
 
 		 248 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  36.41 
 
 		 285 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  36.52 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  32.47 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  30.37 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  34.78 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  32.65 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  28.42 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  28.42 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  28.76 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  31.17 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  34.5 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  29.12 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  30.53 
 
 		 289 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  30.33 
 
 		 236 aa  87.8  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  30.54 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  30.25 
 
 		 289 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  30.53 
 
 		 238 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  30.53 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  26.27 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  29.52 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  32.97 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  27.87 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0123  hypothetical protein  34.66 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00966496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  32.43 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  27.37 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  29.32 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  28.26 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  27.38 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1212  hypothetical protein  32.57 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.455556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2241  hypothetical protein  31.38 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  28.99 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  32.43 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1893  hypothetical protein  34.12 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100448 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  27.81 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  27.49 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0310  hypothetical protein  34.42 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  27.43 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  25.7 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0328  hypothetical protein  33.12 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  30.48 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  27.51 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  26.01 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  26.79 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  25.62 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  29.13 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  23.73 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  26.52 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  28.8 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  28.23 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  30.71 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  31.4 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>