162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0144 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  43.24 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  43.24 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  41.44 
 
 
235 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  39.01 
 
 
235 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  37.36 
 
 
236 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  37.37 
 
 
233 aa  125  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  40.56 
 
 
208 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  39.89 
 
 
218 aa  118  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  35.29 
 
 
235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  34.76 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  37.08 
 
 
234 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  41.53 
 
 
214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  35 
 
 
224 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  38.3 
 
 
231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  35.5 
 
 
230 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  36.18 
 
 
244 aa  104  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  34.13 
 
 
257 aa  104  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  36.47 
 
 
248 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  32.8 
 
 
241 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  36.84 
 
 
235 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  101  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  37.2 
 
 
259 aa  101  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  29.57 
 
 
228 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  30.11 
 
 
219 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  30.16 
 
 
219 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  32.93 
 
 
245 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  34.38 
 
 
298 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  29.1 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  29.78 
 
 
229 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  35.93 
 
 
241 aa  95.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  29.03 
 
 
234 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  29.57 
 
 
234 aa  92  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  29.57 
 
 
234 aa  92  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  31.72 
 
 
266 aa  91.3  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  29.61 
 
 
230 aa  90.9  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  30.34 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  29.78 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  35.23 
 
 
256 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  33.15 
 
 
261 aa  88.6  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  30.91 
 
 
289 aa  88.2  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  35.03 
 
 
234 aa  87  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  29.05 
 
 
223 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  31.06 
 
 
289 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  29.09 
 
 
258 aa  85.5  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  26.88 
 
 
242 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  30.22 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  30.99 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  27.87 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  29.67 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  31.25 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  35 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  28.96 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  28.33 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  30.38 
 
 
244 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  32.28 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  32.28 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  32.28 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  27.43 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  27.43 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  31.68 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  30.25 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  29.66 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  29.66 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  29.66 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  27.78 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  26.11 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  27.67 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  24.86 
 
 
236 aa  71.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  27.51 
 
 
249 aa  71.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  32.1 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  30.05 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  28.34 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  23.17 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  27.84 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  30.25 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  26.7 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  29.53 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  27.78 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  28.4 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  29.23 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  30.25 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  28.4 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  28.4 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  29.11 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  28.4 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  27.52 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  29.86 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  30.86 
 
 
219 aa  62  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  27.88 
 
 
219 aa  61.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  25.89 
 
 
269 aa  61.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  30.3 
 
 
227 aa  61.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  32.33 
 
 
223 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  28.75 
 
 
245 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>