111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12650 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  77.33 
 
 
235 aa  360  8e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  42.01 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  39.62 
 
 
259 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  41.84 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  37.02 
 
 
245 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  37.86 
 
 
234 aa  121  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  40.93 
 
 
235 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  36.47 
 
 
185 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  32.74 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  29.74 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  33.5 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  35.41 
 
 
228 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  32.41 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28.69 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  28.76 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  35.78 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  27.19 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  29.8 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  31.82 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  28.45 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  33.7 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  26.67 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  33.66 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  28.06 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  32.37 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  30.1 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  25.23 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  31.79 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  29.95 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  25.23 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  26.05 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  26.85 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  24.77 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  31.36 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  23.97 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  29.38 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  29.78 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  26.03 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  28.24 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  30.63 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  30.63 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  26.51 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  28.07 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  26.53 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  25.46 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  27.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  26.47 
 
 
224 aa  62  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  27.43 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  26.82 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  28.21 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  28.21 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  28.21 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  24.22 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  23.46 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  24.26 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  23.85 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  28.37 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  23.85 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  27.01 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  26.54 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  28.36 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  22.73 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  22.22 
 
 
254 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  25.43 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  26.44 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  24.57 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  25.31 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  23.03 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  24.4 
 
 
252 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  24.4 
 
 
252 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  25.79 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  27.37 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  25 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  28.4 
 
 
222 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  27.72 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  25.86 
 
 
219 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  24.63 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  25.73 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  26.62 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  21.67 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  24.88 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  26.62 
 
 
219 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  26.62 
 
 
219 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  28.22 
 
 
234 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  26.62 
 
 
219 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  21.11 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  24.31 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  25.66 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  24.68 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  21.59 
 
 
470 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  21.59 
 
 
470 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  29.32 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  26.58 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  25.86 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  25.32 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>