95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0375 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  99.58 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  76.79 
 
 		 244 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  67.81 
 
 		 236 aa  331  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  61.64 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  58.41 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  56.03 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  56.77 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  56.67 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  51.32 
 
 		 223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  53.1 
 
 		 230 aa  231  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  49.78 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  43.91 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  41.28 
 
 		 216 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  42.11 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  43.06 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  43.98 
 
 		 219 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  43.52 
 
 		 219 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  36.6 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  35.37 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  32.8 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  32.8 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  37.61 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  35.87 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  34.45 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  34.1 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  33.01 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  34.45 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  34.45 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  32.34 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  34.07 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  34.07 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  34.07 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  29.05 
 
 		 475 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  29.61 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  29.57 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  32.43 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  32.76 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  30.59 
 
 		 262 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  31.89 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  30.53 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  30.53 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  28.7 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  31.35 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  30.11 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  31.35 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  31.11 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  28.14 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  28.44 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  32.28 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  28.65 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  26.67 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  26.98 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  27.72 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  30.37 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  28.21 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  34.13 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  29.94 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  28.19 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  26.37 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  26.15 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  29.95 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  24.37 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  28.3 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  27.61 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  28.47 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  30.41 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  28.78 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  28.44 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  28.35 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  30.72 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  29.75 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  23.85 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  26.56 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  24.56 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  27.38 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  23.44 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0028  hypothetical protein  24.6 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  26.36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0060  hypothetical membrane spanning protein  23.66 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  26.11 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  28.12 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  25.16 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  24.86 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  27.34 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  20.5 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2936  hypothetical protein  24.57 
 
 		 429 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2790  hypothetical protein  24.57 
 
 		 429 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  22.56 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  25.4 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  24.29 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  23.56 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  23.03 
 
 		 172 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>