142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1915 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  59.09 
 
 
262 aa  323  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  57.36 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  49.6 
 
 
266 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  49.42 
 
 
256 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  47.62 
 
 
261 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  48.45 
 
 
258 aa  215  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  42 
 
 
219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  40.23 
 
 
257 aa  175  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  35.52 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  28.74 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  31.72 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  28.4 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  27.64 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  28.86 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  28.23 
 
 
223 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  33.99 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  31.11 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  32.49 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  34.43 
 
 
224 aa  84  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  27.84 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  26.27 
 
 
234 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  30.65 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  27.45 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  26.61 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  29.9 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  26.69 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  26.61 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  28.14 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  28.14 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  23.87 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  25.71 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  29.05 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  28.19 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  24.35 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  30.73 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  31.4 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  30.6 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  72  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  25.25 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  25.82 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  24.77 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  25.91 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  28.19 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  25.91 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  29.03 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  29.03 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  25.91 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  34.53 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  29.38 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  29.32 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  23.3 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  23.3 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  23.3 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  29.83 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  29.85 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  26.09 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  25.64 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  25.59 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  25.59 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  25.59 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  25.59 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  25.59 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  25.51 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  27 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  25.51 
 
 
221 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  25.51 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  26.42 
 
 
224 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  25.36 
 
 
221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  25.36 
 
 
221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  25.36 
 
 
221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  27.53 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  27.93 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  28.41 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  25.51 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  25.51 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  27.88 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  24.66 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  25.13 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  26.14 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  26.47 
 
 
221 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  26.79 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  26.15 
 
 
224 aa  56.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  26.53 
 
 
223 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  21.11 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  24.32 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  26.14 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  23.78 
 
 
208 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  25.65 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  26.15 
 
 
217 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  29.38 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  25.62 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>