139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2496 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  66.52 
 
 
248 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  64.66 
 
 
249 aa  285  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  62.13 
 
 
285 aa  271  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  58.41 
 
 
238 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  58.41 
 
 
238 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  57.39 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  53.25 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  57.71 
 
 
232 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  48.88 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  49.78 
 
 
223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  47.09 
 
 
225 aa  205  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  45.33 
 
 
228 aa  194  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  43.89 
 
 
242 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  49.04 
 
 
219 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  48.56 
 
 
219 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  49.04 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  39.32 
 
 
216 aa  175  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  40.57 
 
 
242 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  39.71 
 
 
229 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  38.28 
 
 
277 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  33.33 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  35.48 
 
 
226 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  38.35 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  35.65 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  35.47 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  33.04 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  33.63 
 
 
230 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  33.94 
 
 
226 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  33.94 
 
 
226 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  33.94 
 
 
226 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  32.38 
 
 
262 aa  108  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  33.83 
 
 
251 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  29.41 
 
 
209 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  32.8 
 
 
185 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  33.16 
 
 
236 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  31.79 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  26.86 
 
 
475 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  30.36 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  30.41 
 
 
289 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  28.16 
 
 
262 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  31.36 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  28 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  27.86 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  28.99 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  26.4 
 
 
208 aa  90.1  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  29.06 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  33.99 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  29.69 
 
 
236 aa  85.5  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  27.01 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0028  hypothetical protein  24.87 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  31.37 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  26.44 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  30.86 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  26.44 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  27 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  28.97 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  29.7 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  30.81 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  25.63 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  26.7 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  30.17 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  29.75 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0060  hypothetical membrane spanning protein  24.86 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  28.18 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  27.42 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  27.37 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  24.34 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  26.2 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  28.39 
 
 
204 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  28.42 
 
 
259 aa  71.6  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  27.49 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0328  hypothetical protein  29.94 
 
 
236 aa  62  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373253  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  27.14 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  23.93 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  25.47 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0310  hypothetical protein  29.34 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  24.1 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  26.87 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  28.36 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  22.95 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  26.26 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  26.43 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  26.12 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  26.87 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  26.83 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  25.69 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1212  hypothetical protein  31.91 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.455556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  25.17 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2241  hypothetical protein  28.73 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  25.37 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  26.12 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0123  hypothetical protein  30.5 
 
 
221 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00966496  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  23.84 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>