135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3679 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  78.54 
 
 		 219 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  78.54 
 
 		 219 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  78.54 
 
 		 219 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  78.54 
 
 		 219 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  78.34 
 
 		 219 aa  359  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  77.13 
 
 		 223 aa  357  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  78.54 
 
 		 226 aa  357  8e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  78.83 
 
 		 221 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  82.38 
 
 		 219 aa  349  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  79.91 
 
 		 219 aa  348  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  76.61 
 
 		 219 aa  344  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  78.54 
 
 		 219 aa  340  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  78.8 
 
 		 217 aa  337  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  78.8 
 
 		 217 aa  337  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  78.8 
 
 		 217 aa  337  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  73.27 
 
 		 219 aa  329  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  64.11 
 
 		 224 aa  279  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  63.64 
 
 		 245 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  64.11 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  61.29 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  60.83 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  60.83 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  61.72 
 
 		 227 aa  267  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  62.33 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  62.33 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  62.33 
 
 		 222 aa  266  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  60.37 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  60.37 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  60.37 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  60.37 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  60.37 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  60.37 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  61.9 
 
 		 222 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  59.46 
 
 		 222 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  59.81 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  60.37 
 
 		 221 aa  265  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  61.9 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  57.08 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  61.43 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  60.38 
 
 		 225 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  58.99 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  58.88 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  58.88 
 
 		 221 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  58.88 
 
 		 246 aa  257  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  59.91 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  60.85 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  58.41 
 
 		 221 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  58.41 
 
 		 221 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  61.24 
 
 		 221 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  57.28 
 
 		 217 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  62.77 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  49.46 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  46.8 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  32.35 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  32.35 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  34.26 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  35.19 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  41.51 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  34.22 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  35.65 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  35.47 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  34.45 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  33.82 
 
 		 181 aa  98.6  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  32.67 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  30.52 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  34.34 
 
 		 186 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  33.48 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  42.14 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  42.14 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  32.76 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  30.25 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  33.95 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  30.21 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  27.04 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  26.09 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  32.72 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  22.55 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  30.65 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  26.81 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  28.41 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.54 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  27.59 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.54 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  27.75 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  25.77 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  30.72 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  28.05 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  27.27 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  29.68 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  26.63 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>