97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3163 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  83.39 
 
 
289 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  69.9 
 
 
298 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  37.4 
 
 
219 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  37.4 
 
 
219 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  36.64 
 
 
219 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  31.95 
 
 
216 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  35.29 
 
 
285 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  34.57 
 
 
252 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  34.57 
 
 
252 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  34.69 
 
 
226 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  34.69 
 
 
226 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  34.69 
 
 
226 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  31.12 
 
 
228 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  32.43 
 
 
241 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  32.73 
 
 
229 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  30.52 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  29.31 
 
 
230 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  27.59 
 
 
226 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  31.44 
 
 
230 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  29.41 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  32.97 
 
 
208 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  31.08 
 
 
232 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  30.53 
 
 
212 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  30.53 
 
 
212 aa  89.7  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  30.57 
 
 
249 aa  89  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  31.09 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  31.65 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  30.65 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  34.18 
 
 
236 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  29.67 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  31.06 
 
 
185 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  30.23 
 
 
257 aa  85.9  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  31.29 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  32.18 
 
 
241 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  30.89 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  28.22 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  29.56 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  32.62 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  28.89 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  29.48 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  29.89 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  27.23 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  28.19 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  29.88 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  25.12 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  29.82 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  24.87 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  29.45 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  24.37 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  28.75 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  25.97 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  31.01 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  24.88 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  26.99 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  27.85 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  26.14 
 
 
234 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  26.14 
 
 
234 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  24.29 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  24.2 
 
 
234 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  24.26 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  27.61 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  27.27 
 
 
218 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  23.08 
 
 
269 aa  58.9  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  26.23 
 
 
207 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  30.77 
 
 
224 aa  58.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  24.66 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  28.57 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  31.58 
 
 
234 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  22.64 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  23.94 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  27.61 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  23.66 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  23.35 
 
 
475 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  30.22 
 
 
214 aa  52.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  26.71 
 
 
214 aa  52.4  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0028  hypothetical protein  23.33 
 
 
206 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275505  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0060  hypothetical membrane spanning protein  23.33 
 
 
206 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  23.23 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  25.39 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1212  hypothetical protein  28.89 
 
 
225 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.455556 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  29.49 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  23.4 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2241  hypothetical protein  26.97 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  27.67 
 
 
207 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  23.35 
 
 
220 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  28.39 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  25.62 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  22.77 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0123  hypothetical protein  25.73 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00966496  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  27.34 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1893  hypothetical protein  26.35 
 
 
220 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  26.62 
 
 
208 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  22.05 
 
 
204 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  22.91 
 
 
219 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>