152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2677 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  38.25 
 
 		 263 aa  178  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  40.23 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  37.45 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  34.9 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  38.5 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  36.65 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  42.08 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  35.91 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  36.57 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  31.6 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  33.05 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  36.99 
 
 		 245 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  35.27 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  32.88 
 
 		 212 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  32.88 
 
 		 212 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  29.75 
 
 		 230 aa  112  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  36.11 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  35.93 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  36.81 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  32.34 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  35.8 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  34.74 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  32.18 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  31.88 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  31.36 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  32.76 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  30.22 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  32.76 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  30.51 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  29.13 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  30.24 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  32.04 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  29.56 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  32.89 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  29.06 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  29.13 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  29.06 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  36.07 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  32.12 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  28.22 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  34.81 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  31.47 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  27.69 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  25.87 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  31.06 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  29.38 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  30.3 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  26.26 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  24.09 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  27.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  27.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  27.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  32.9 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  29.34 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  26.17 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  25.82 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  26.2 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  28.82 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  27.54 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  27.68 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  27.54 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  27.33 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  29.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  24.07 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  25.32 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  25.32 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  23.94 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  28.49 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  28.49 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  28.49 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  28.49 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  31.94 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  26.75 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  31.43 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  28.97 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  30.32 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  29.07 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  23.5 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  28.08 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  29.77 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  30.65 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  31.11 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>