84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3147 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  61.81 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  48.09 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  47.92 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  47.92 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  47.92 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  44.59 
 
 		 277 aa  191  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  41.77 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  40.33 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  39.92 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  39.15 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  40.37 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  36.57 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  35.39 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  39.45 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  33.04 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  38.46 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  34.38 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  33.49 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  34.1 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  34.1 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  33.18 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  34.42 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  34.42 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  40.12 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  33.49 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  34.31 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  34.8 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  37.64 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  28.93 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  31.29 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  28.77 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  28.77 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  33.6 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  26.69 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  25.87 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  29.65 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  26.67 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  28.32 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  24.57 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  27.23 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  26.67 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  29.55 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  28.16 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  28.16 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  27.31 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  22.62 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  27.71 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  27.14 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  26.79 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  27.57 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  26.79 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  31.36 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  27.08 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  29.76 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  22.75 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  25.9 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  21.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  25.47 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  26.73 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  27.05 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  27.19 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  24.03 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  27.05 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  25.62 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  25.62 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  30 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  30.19 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  26.26 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  24.02 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  33.06 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0123  hypothetical protein  30.09 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00966496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  25.19 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  24.86 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  27.38 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  23.75 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>