129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2053 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  424  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  85.64 
 
 
218 aa  358  4e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  40.2 
 
 
231 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  41.53 
 
 
185 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  41.76 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  35.33 
 
 
212 aa  101  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  35.33 
 
 
212 aa  101  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  38.97 
 
 
230 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  35.75 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  35.84 
 
 
234 aa  98.6  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  34.17 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  37.14 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  34.81 
 
 
257 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  37.08 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  32.37 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  31.58 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  30.48 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  32.57 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  35.97 
 
 
266 aa  75.1  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  32.95 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  30.9 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  28.66 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  31.34 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  29.8 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  30.22 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  27.39 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  27.47 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  31.62 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  28.26 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  25.93 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  26.75 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  29.07 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  26.23 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  26.63 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  31.85 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  28.06 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  29.66 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  29.29 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  31.45 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  31.45 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  31.45 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  31.34 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  33.12 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  27.82 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  24.1 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  28.31 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  28.67 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  31.58 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  26.43 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  29.69 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  29.77 
 
 
252 aa  61.6  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  29.77 
 
 
252 aa  61.6  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  26.92 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  28.31 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  25.53 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  25.93 
 
 
244 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  27.33 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  25.74 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  25.74 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  27.69 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  26.11 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  29.92 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  28.99 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  24.88 
 
 
277 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  27.33 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  26.24 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  27.68 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  28.49 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  27.46 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  28.49 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  28.49 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  28.49 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  24.06 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  28.18 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  27.11 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  28.24 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  27.46 
 
 
285 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  25.65 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  25.16 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  25.16 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  27.98 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  27.98 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  27.98 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  52  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  24.7 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  24.39 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  29.29 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  29.29 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  27.03 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  27.04 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  30.07 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  27.11 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  28.91 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  27.12 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  29.69 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>