113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4070 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  87.44 
 
 
223 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  76.23 
 
 
225 aa  348  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  77.31 
 
 
225 aa  348  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  73.61 
 
 
222 aa  331  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  73.61 
 
 
222 aa  331  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  73.15 
 
 
222 aa  330  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  75.24 
 
 
221 aa  329  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  74.3 
 
 
221 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  74.3 
 
 
221 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  74.3 
 
 
246 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  74.3 
 
 
221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  74.3 
 
 
221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  73.46 
 
 
221 aa  324  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  73.46 
 
 
221 aa  324  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  72.99 
 
 
221 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  72.99 
 
 
221 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  72.99 
 
 
221 aa  322  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  72.99 
 
 
221 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  72.99 
 
 
221 aa  322  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  72.99 
 
 
221 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  73.83 
 
 
221 aa  320  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  72.86 
 
 
221 aa  318  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  64.45 
 
 
227 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  66.19 
 
 
224 aa  287  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  65.71 
 
 
223 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  65.71 
 
 
245 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  63.85 
 
 
221 aa  274  9e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  59.46 
 
 
222 aa  265  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  60 
 
 
224 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  64.4 
 
 
217 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  56 
 
 
236 aa  252  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  62.44 
 
 
218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  56.62 
 
 
226 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  59.81 
 
 
219 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  60.8 
 
 
216 aa  248  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  55.2 
 
 
223 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  55.41 
 
 
221 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  57.42 
 
 
219 aa  244  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  56.87 
 
 
219 aa  244  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  59.7 
 
 
219 aa  241  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  59.7 
 
 
217 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  59.7 
 
 
217 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  59.7 
 
 
217 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  58.71 
 
 
219 aa  240  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  57.56 
 
 
222 aa  238  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  55.98 
 
 
219 aa  236  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  57.07 
 
 
222 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  56.94 
 
 
219 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  56.94 
 
 
219 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  56.94 
 
 
219 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  56.94 
 
 
219 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  53.44 
 
 
225 aa  191  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  52.58 
 
 
225 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  34.2 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  33.48 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  35.41 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  34.93 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  36.93 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  33.97 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  32.85 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  30.32 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  33 
 
 
216 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  33.01 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  29.21 
 
 
204 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  35.33 
 
 
186 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  41.22 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  31.03 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  31.03 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  34.46 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  41.13 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  41.13 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  28.8 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.44 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.44 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  26.03 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  29.65 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  29.65 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  30.18 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  25.7 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  26.05 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  26.61 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  25.97 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  25.25 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  28.78 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.82 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  27.72 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  26.29 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  24.43 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  26.55 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  26.55 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  26.62 
 
 
219 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  24.84 
 
 
235 aa  47  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  26.62 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  27.78 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  24.71 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  26.52 
 
 
263 aa  45.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  27.97 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>