123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3073 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  397  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  63.08 
 
 
223 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  62.56 
 
 
223 aa  251  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  63.59 
 
 
216 aa  251  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  52.11 
 
 
220 aa  204  6e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  56.37 
 
 
211 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  55.39 
 
 
211 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  52 
 
 
210 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  54.9 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  53.4 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  47.15 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  46.82 
 
 
208 aa  165  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  49.75 
 
 
210 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  51.09 
 
 
181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  48.91 
 
 
189 aa  157  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  54.55 
 
 
208 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  54.04 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  54.04 
 
 
208 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  48.33 
 
 
204 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  36.07 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  37.02 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  36.06 
 
 
245 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  35.58 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  36.54 
 
 
227 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  34.93 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  34.93 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  33.97 
 
 
222 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  37.02 
 
 
221 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  33.97 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  34.76 
 
 
219 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  34.45 
 
 
226 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  34.93 
 
 
219 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  34.93 
 
 
219 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  33.49 
 
 
219 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  34.93 
 
 
219 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  34.93 
 
 
219 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  35.68 
 
 
219 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  33.65 
 
 
223 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  36.06 
 
 
221 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  36.06 
 
 
221 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  41.33 
 
 
224 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  35.35 
 
 
221 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  34.25 
 
 
225 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  36.06 
 
 
222 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  36.06 
 
 
222 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  36.06 
 
 
222 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  35.58 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  35.45 
 
 
217 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  36.82 
 
 
216 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  35.58 
 
 
246 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  33.49 
 
 
225 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  35.05 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  35.1 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  34.45 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  33.18 
 
 
236 aa  95.1  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  40.28 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  40.28 
 
 
222 aa  92  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  33.17 
 
 
223 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  31.54 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  31.39 
 
 
262 aa  55.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  30.06 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  30.91 
 
 
229 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  29.03 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  29.03 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  28.68 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  32.06 
 
 
259 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  22.7 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4383  protein of unknown function DUF165  34.4 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  28.06 
 
 
233 aa  48.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  24.82 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  32.21 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  26.32 
 
 
266 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  28.19 
 
 
236 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  32.35 
 
 
155 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  32.26 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  32.35 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  28.12 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  30.39 
 
 
155 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  28.95 
 
 
230 aa  45.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  29.77 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  29.77 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  29.77 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  25.56 
 
 
235 aa  44.7  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>