15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4163 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  94.19 
 
 
155 aa  269  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  95.07 
 
 
155 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4265  hypothetical protein  95.07 
 
 
155 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  82.58 
 
 
155 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  82.58 
 
 
155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1467  hypothetical protein  80.65 
 
 
155 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0370  protein of unknown function DUF165  37.04 
 
 
253 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0159  hypothetical protein  37.21 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3889  hypothetical protein  33.06 
 
 
166 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168768  normal  0.374571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  31.06 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  35.48 
 
 
179 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  30.89 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  29.13 
 
 
181 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>