15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1061 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  98.71 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4265  hypothetical protein  98.06 
 
 		 155 aa  296  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  94.37 
 
 		 155 aa  268  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  81.94 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  81.94 
 
 		 155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1467  hypothetical protein  79.35 
 
 		 155 aa  248  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0370  protein of unknown function DUF165  38.27 
 
 		 253 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0159  hypothetical protein  34.88 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3889  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168768  normal  0.374571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  34.41 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  30.89 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  36.56 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  36.11 
 
 		 208 aa  43.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4383  protein of unknown function DUF165  35.83 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>